Browsing by Author "Rosales V., Marlene"

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    A remarkable synergistic effect at the transcriptomic level in peach fruits doubly infected by prunus necrotic ringspot virus and peach latent mosaic viroid
    (2013) Herranz, Mari C.; Niehl, Annette; Rosales V., Marlene; Fiore, Nicola; Zamorano, Alan; Granell, Antonio; Pallas, Vicente
    Abstract Background Microarray profiling is a powerful technique to investigate expression changes of large amounts of genes in response to specific environmental conditions. The majority of the studies investigating gene expression changes in virus-infected plants are limited to interactions between a virus and a model host plant, which usually is Arabidopsis thaliana or Nicotiana benthamiana. In the present work, we performed microarray profiling to explore changes in the expression profile of field-grown Prunus persica (peach) originating from Chile upon single and double infection with Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) and Peach latent mosaic viroid (PLMVd), worldwide natural pathogens of peach trees. Results Upon single PLMVd or PNRSV infection, the number of statistically significant gene expression changes was relatively low. By contrast, doubly-infected fruits presented a high number of differentially regulated genes. Among these, down-regulated genes were prevalent. Functional categorization of the gene expression changes upon double PLMVd and PNRSV infection revealed protein modification and degradation as the functional category with the highest percentage of repressed genes whereas induced genes encoded mainly proteins related to phosphate, C-compound and carbohydrate metabolism and also protein modification. Overrepresentation analysis upon double infection with PLMVd and PNRSV revealed specific functional categories over- and underrepresented among the repressed genes indicating active counter-defense mechanisms of the pathogens during infection. Conclusions Our results identify a novel synergistic effect of PLMVd and PNRSV on the transcriptome of peach fruits. We demonstrate that mixed infections, which occur frequently in field conditions, result in a more complex transcriptional response than that observed in single infections. Thus, our data demonstrate for the first time that the simultaneous infection of a viroid and a plant virus synergistically affect the host transcriptome in infected peach fruits. These field studies can help to fully understand plant-pathogen interactions and to develop appropriate crop protection strategies.Abstract Background Microarray profiling is a powerful technique to investigate expression changes of large amounts of genes in response to specific environmental conditions. The majority of the studies investigating gene expression changes in virus-infected plants are limited to interactions between a virus and a model host plant, which usually is Arabidopsis thaliana or Nicotiana benthamiana. In the present work, we performed microarray profiling to explore changes in the expression profile of field-grown Prunus persica (peach) originating from Chile upon single and double infection with Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) and Peach latent mosaic viroid (PLMVd), worldwide natural pathogens of peach trees. Results Upon single PLMVd or PNRSV infection, the number of statistically significant gene expression changes was relatively low. By contrast, doubly-infected fruits presented a high number of differentially regulated genes. Among these, down-regulated genes were prevalent. Functional categorization of the gene expression changes upon double PLMVd and PNRSV infection revealed protein modification and degradation as the functional category with the highest percentage of repressed genes whereas induced genes encoded mainly proteins related to phosphate, C-compound and carbohydrate metabolism and also protein modification. Overrepresentation analysis upon double infection with PLMVd and PNRSV revealed specific functional categories over- and underrepresented among the repressed genes indicating active counter-defense mechanisms of the pathogens during infection. Conclusions Our results identify a novel synergistic effect of PLMVd and PNRSV on the transcriptome of peach fruits. We demonstrate that mixed infections, which occur frequently in field conditions, result in a more complex transcriptional response than that observed in single infections. Thus, our data demonstrate for the first time that the simultaneous infection of a viroid and a plant virus synergistically affect the host transcriptome in infected peach fruits. These field studies can help to fully understand plant-pathogen interactions and to develop appropriate crop protection strategies.
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    Aplicación de método convencional y PCR de punto final para la detección de aislados chilenos de Xanthomonas campestris pv. campestris
    (2022) Urzúa Vega, Sofía; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
    La "mancha angular" causada por la bacteria Xantomonas campestris pv. campestris (Xcc) es la principal enfermedad, que afecta a los cultivos de la familia de brásicas y presenta una distribución mundial. Esta bacteria posee un ciclo de vida corto, de fácil dispersión y difícil control de la enfermedad que ocasiona. En Chile, un sector importante del mercado agrícola depende de la producción de semillas de las especies de esta familia, tanto que el valor de sus exportaciones suma un total de 77,1 millones de dólares FOB. Este estudio tiene como objetivo identificar la presencia de Xcc en muestras tomadas de 5 regiones distintas del país y posterior comparación entre dos métodos de identificación, contrastando métodos microbiológicos tradicionales y análisis moleculares. Se tomaron muestras de 34 localidades de hojas con síntomas, malezas relacionadas al cultivo y suelo, de las cuales se obtuvo un cultivo y aislamiento primario obteniendo una colección de 196 aislados. Fueron registradas características morfológicas de las colonias en medio YDC, considerándose como candidatas a Xcc, las colonias amarillas de aspecto mucoide. Por otra parte, también se utilizó la reacción PCR del gen patovar específico hrpF para identificar los aislados Xcc. Los resultados de ambos métodos fueron contrastados obteniendo una predicción positiva mayor por muestra a través del método convencional. Sin embargo, se concluyó que ambos métodos se complementan para realizar un diagnóstico eficiente, donde el método convencional sirve como un primer filtro para la gran diversidad de bacterias obtenidas del cultivo inicial, a pesar de no ser especifico como el PCR.
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    Characterization and Pathogenicity of Botryosphaeriaceae Species Obtained from Avocado Trees with Branch Canker and Dieback and from Avocado Fruit with Stem End Rot in Chile
    (2019) Valencia Díaz, Ana Luisa; Gil Montenegro, Pilar Macarena; Latorre G., Bernardo; Rosales V., Marlene
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    Characterization of the Bull's Eye Rot of Apple in Chile
    (2013) Soto Alvear, Sylvana; Lolas, Mauricio; Rosales V., Marlene; Chávez, Eduardo R.; Latorre G., Bernardo
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    Characterization of viral agents present in tomato crops in Arica and Parinacota Region of Northern Chile
    (2019) Rojas Bertini, Claudia Andrea; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
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    Cultivo de cebolla en Chile : claves para una producción sostenible
    (2016) Contreras E., Samuel; Kelly, E.; Chorbadjian Alonso, Rodrigo Armen; Figueroa Espinoza, Rodrigo; Krarup Hjort, Christian Frederik; Norero, Y.; Rosales V., Marlene
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    Divergent molecular and growth responses of young "Cabernet Sauvignon" (Vitis vinifera) plants to simple and mixed infections with grapevine rupestris stem pitting-associated virus
    (2020) Tobar, M.; Fiore, N.; Pérez Donoso, Alonso Gastón; León, R.; Rosales V., Marlene; Gambardella C., Marina
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    Estudio de factores medioambientales para el desarrollo de la pudrición negra en brásicas causada por Xanthomonas campestris pv. campestris
    (2020) Chue Caneleo, Víctor; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
    Xanthomonas campestris pv. campestris es uno de los patógenos más importantes en la producción de brásicas. Este patógeno se disemina principalmente por semillas por semillas e ingresa a las plantas a través de los hidátodos provocando lesiones en los márgenes de las hojas en forma de “V”. La sobrevivencia y desarrollo de Xcc se ve afectada por factores climáticos como temperatura y humedad relativa. El objetivo de este trabajo fue analizar las condiciones predisponentes para la pudrición negra de las brásicas basándose en temperatura y humedad relativa para la aparición de Xcc en la zona central de Chile. Se analizaron 30 estaciones meteorológicas distribuidas entre la región Metropolitana y Ñuble para determinar análisis mensuales y anuales. Se realizó un análisis del comportamiento de la temperatura mínima media, media, máxima media y humedad relativa durante los últimos 5 años y se contrastaron los resultados con condiciones medioambientales descritas para Xcc. Los resultados variaron entre región y entre tipo de análisis, reportando los meses de verano los más probables para la aparición de la enfermedad tomando en cuenta la temperatura máxima media. Sin embargo, para el análisis tomando en cuenta la temperatura mínima media y media arrojó bajas probabilidades de aparición de Xcc. Las condiciones climáticas de Chile podrían no favorecer el desarrollo de Xcc, sin embargo, existen reportes del patógeno en zonas con condiciones climáticas similares a las de Chile, además, se debe considerar la adaptación de los patógenos a cada localidad y los efectos del cambio climático en la distribución de microorganismos.
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    Evaluación de la sensibilidad al cobre en Xanthomonas campestris pv. campestris y análisis comparativo de genes relacionados a la homeostasis del cobre
    (2022) Maza Bengoa, Teresa de la; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
    La pudrición negra de brassicas causada por Xanthomonas campestris pv campestris (Xcc) se ha tratado históricamente con productos en base a cobre. Algunas bacterias han desarrollado resistencia a este metal debido a la expresión de genes que se encuentran formando el operón cop, los cuales codifican proteínas multicobre oxidasas. En Chile se han reportado niveles crecientes de resistencia en otros patovares de Xanthomonas, sin embargo no hay estudios en Xcc. El objetivo de esta tesis fue evaluar in vitro la sensibilidad al cobre de aislados de Xcc recolectados en la zona central de Chile y realizar un análisis comparativo de genes relacionados a la resistencia al cobre, entre aislados chilenos y otros aislados de Xanthomonas caracterizados en bases de datos de NCBI. Se evaluó la concentración mínima inhibitoria (CMI) en placas con distintas concentraciones de sulfato de cobre. Se alinearon las secuencias de genes cop, se buscaron zonas conservadas y se construyeron árboles filogenéticos para cada uno de los genes. Todos los aislados chilenos se clasificaron como sensibles al cobre y se determinó que los genes copA y cutC son los más conservados entre Xanthomonas. Además, las mayores diferencias en los genes cop se presentaron entre plásmidos de aislados resistentes y aquellos encontrados en aislados chilenos.
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    Evaluación de patogenicidad de Xanthomonas campestris pv. campestris, y del potencial biocontrolador de una mezcla de bacteriófagos líticos contra la mancha angular de las brásicas
    (2023) Valdivia Gómez, Francisco Javier; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
    Xanthomonas campestris pv. campestris es una bacteria gram negativa causante de la mancha angular de las brásicas. Esta enfermedad, económicamente importante para el cultivo, tiene un difícil control por su ciclo de vida, capacidad de sobrevivencia y resistencia al control químico. El objetivo de este trabajo fue determinar diferencias en la patogenicidad de distintos aislados de Xcc y evaluar el control de esta enfermedad utilizando bacteriófagos líticos específicos para esta bacteria. Para este propósito, se evaluó la incidencia, severidad y concentración bacteriana en plantas de repollo inoculadas con siete diferentes aislados. Además, se evaluó la incidencia, severidad y concentración bacteriana de tratamientos de control curativo y preventivo contra la enfermedad. Todos los resultados obtenidos se analizaron mediante ANOVA y comparación de medias. Fue posible establecer aislados patogénicos y no patogénicos basados en la construcción de curvas de progreso de la enfermedad. X9, S2M9-2 y X32 destacan por su mayor nivel de patogenicidad sobre los demás aislados, mientras que X45 y X90 no mostraron patogenicidad. No fue posible corroborar la capacidad de biocontrol de Fagos en tratamientos preventivos de la enfermedad, pero los tratamientos curativos con los tratamientos Oxicloruro de cobre, Biosubtillis y Fagos obtuvieron un menor valor de AUDPC que el control bacteriano.
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    Evaluation of growing and photosynthetic parameters in response to simple and mixed infections with GRSPaV in plants of Vitis vinifera L., "Cabernet Sauvignon" cultivar and study of new strategies of GRSPaV elimination
    (2019) Tobar Urzúa, Mariola; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
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    First Report of Potato mop-top virus in Chile
    (2016) Pena, E.; Gutierrez, M.; Montecinos, A.; Munoz, M.; Vargas, E.; Acuna, I.; Gutiérrez Ilabaca, Rodrigo Antonio; Rosales V., Marlene
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    First report of potato mop-top virus infecting potato in southern Chile
    (2016) Pena, E.; Gutierrez, M.; Montecinos, A.; Munoz, M.; Vargas, E.; Acuna, I.; Gutiérrez Ilabaca, Rodrigo Antonio; Rosales V., Marlene
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    Identification and geographic distribution of genetic groups of Erysiphe necator in Chilean vineyards
    (2014) Araya, C.; Rosales V., Marlene; Méndez Lesser, Manuel; Delmotte, F.
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    Interaction and management of begomoviruses and whiteflies in weeds and horticulture crops in the State of São Paulo and survey of orthotospoviruses and associated thrips in the Arica y Parinacota Region - Chile
    (2021) Gorayeb, Eduardo Silva; Rosales V., Marlene; Sakate, Renate Krause; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
    Con el fin de aportar información clave para el manejo de mosquitas blancas, trips, Orthotospovirus y begomovirus en cultivos de tomate (Solanum lycopersicum L.), pepino (Cucumis sativus L.) y pimiento (Capsicum spp.), Esta tesis contempla dos estudios que involucran las especies crípticas de B. tabaci MEAM1 y MED en Brasil, y dos estudios de orthotospovirus y trips en Chile. Se estudió Datura stramonium L. y Nicandra physaloides L. (Gaertn.) como huéspedes alternativos de mosquita blanca y del virus de la rugosa severa del tomate (ToSRV), mostrando N. physaloides como un gran huésped alternativo del virus cuando se asocia con MEAM1, mientras que D. stramonium contribuyó más con la reproducción de la mosquita blanca. Luego, se investigaron las causas relacionadas con las recientes infestaciones de MED en pepinos observadas en Brasil, utilizando cultivares comerciales de pepino, demostrando un mejor desempeño de MED en casi todos los cultivares comerciales evaluados y que el desempeño es un factor clave para el predominio de esta mosquita blanca en las plantas de pepino. Finalmente, se reportó por primera vez en Chile el nuevo orthotospovirus putativo Pepper necrotic spot virus, infectando frutos de pimiento morrón, y en ocurrencia conjunta con el TSWV en la región de Arica y Parinacota (Norte de Chile) asociado a F. occidentalis, donde cada vez más casos de la enfermedad conocida por “el Bronceado del tomate/pimiento) está aumentando.
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    Metagenomic approach to study viruses and virus-like pathogens in native potatoes from Chiloé Archipelago
    (2019) Peña Reyes, Elizabeth Carolina; Rosales V., Marlene; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal
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    Survey of stone fruit viruses and viroids in Chile
    (2016) Fiore, N.; Zamorano, A.; Pino, A. M.; González, F.; Rosales V., Marlene; Sánchez Navarro, J. A.; Pallás, V.
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    Variation over time in the prevalences of three viruses of the grapevine leafroll complex in a commercial vineyard in south-central Chile
    (2013) Mujica, María Valentina; Mora, Roxana; Rosales V., Marlene; Sandoval B., Claudio
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