Evaluación de la sensibilidad al cobre en Xanthomonas campestris pv. campestris y análisis comparativo de genes relacionados a la homeostasis del cobre
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Date
2022
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Abstract
La pudrición negra de brassicas causada por Xanthomonas campestris pv campestris (Xcc) se ha tratado históricamente con productos en base a cobre. Algunas bacterias han desarrollado resistencia a este metal debido a la expresión de genes que se encuentran formando el operón cop, los cuales codifican proteínas multicobre oxidasas. En Chile se han reportado niveles crecientes de resistencia en otros patovares de Xanthomonas, sin embargo no hay estudios en Xcc. El objetivo de esta tesis fue evaluar in vitro la sensibilidad al cobre de aislados de Xcc recolectados en la zona central de Chile y realizar un análisis comparativo de genes relacionados a la resistencia al cobre, entre aislados chilenos y otros aislados de Xanthomonas caracterizados en bases de datos de NCBI. Se evaluó la concentración mínima inhibitoria (CMI) en placas con distintas concentraciones de sulfato de cobre. Se alinearon las secuencias de genes cop, se buscaron zonas conservadas y se construyeron árboles filogenéticos para cada uno de los genes. Todos los aislados chilenos se clasificaron como sensibles al cobre y se determinó que los genes copA y cutC son los más conservados entre Xanthomonas. Además, las mayores diferencias en los genes cop se presentaron entre plásmidos de aislados resistentes y aquellos encontrados en aislados chilenos.
Description
Tesis (Magíster en Fisiología y Producción Vegetal)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2022
Keywords
Copper resistance, Copper sulphate, Multicopper oxidases, Operon