Characterization of metabolic interactions between bacteria of the intestinal microbiome during the utilization of dietary fibers
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Date
2023
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Abstract
El microbioma intestinal es una comunidad de microorganismos anaeróbicos. Esta composición puede ser modulada por la ingesta de alimentos ricos en fibras dietéticas, como prebióticos, que son polisacáridos complejos no modificados en el intestino delgado. Estos son fermentados selectivamente por bacterias intestinales, otorgando un beneficio a la salud del huésped. Dentro de estas fibras se incluye la inulina, y el xilano. La inulina es un fructano que es encontrado en cebollas y achicorias. Por otra parte, xilano es un polisacárido complejo de unidades de xilosa con cadenas laterales sustituidas, encontrado en las paredes celulares de las plantas como el maíz. Además, en el microbioma intestinal, existen interacciones bacterianas positivas (cross-feeding), o negativas (competencia) mediadas por el consumo de estas fibras. En este estudio se evaluaron interacciones bacterianas de diferentes cepas del microbioma intestinal de Lactobacillus, Bifidobacterium, Bacteroides, and Phocaeicola mientras consumen inulina o xilano. Ensayos bidireccionales en xilano mostraron que Bifidobacterium longum PT4 aumentó su crecimiento en presencia de Bacteroides ovatus HM222. Los análisis proteómicos indicaron que B. ovatus sintetizó enzimas que degradan xilano, como β-xilanasa, arabinosidasa, y xilosidasa. En presencia de B. ovatus, B. longum PT4 aumentó la producción de enzimas para consumir xilooligosacáridos, como α-L-arabinosidasa, L-arabinosa isomerasa, xilulosa quinasa, xilosa isomerasa y transportadores de azúcar. Por otra parte, ensayos bidireccionales en inulina mostraron un predominio de la competencia por esta fibra por parte de Lacticaseibacillus paracasei M38, cuando interactuó con otras cepas intestinales comensales (Ligilactobacillus ruminis PT16, B. longum PT4 y Bacteroides fragilis HM714) que se vieron desfavorecidas. Los estudios proteómicos destacaron el aumento en cocultivos de las enzimas que degradan la inulina, como la β-fructosidasa, el sistema de transporte PTS D-fructosa y ABC. Posibles características fenotípicas de L. paracasei le dieron una ventaja adaptativa en condiciones adversas. Los resultados confirman la complejidad de las interacciones metabólicas intestinales, las que pueden ser positivas o negativas dependiendo de las cepas involucradas.
Description
Tesis (Doctor in Engineering Sciences)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2023