Decoding the mobilome of marine microbial communities and their composition in response to local environmental conditions

Simple item page
dc.contributor.advisorDiez Moreno, Beatriz
dc.contributor.authorTamayo Leiva, Javier
dc.contributor.otherPontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias Biológicas
dc.date.accessioned2022-06-13T19:04:16Z
dc.date.issued2022
dc.date.updated2022-06-13T16:00:13Z
dc.descriptionTesis (Doctorado en Ciencias Biológicas Mención Genética Molecular y Microbiología)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2022
dc.description.abstractLa transferencia horizontal de genes es un proceso natural que permite que los genomas celulares evolucionen rápidamente al adquirir nuevos rasgos genéticos. Entre los cinco procesos celulares capaces de realizar la transferencia horizontal de genes, la conjugación es el más frecuente. Este mecanismo está implicado en el intercambio de vectores de ADN, llamados elementos genéticos móviles y aquí colectivamente denominados como mobiloma conjugativo. El ambiente marino muestra de forma habitual un dinamismo especialmente elevado. Por esta razón, han existido esfuerzos de investigación de la ecología y diversidad microbiana a gran escala, y por ello es un candidato ideal para el estudio del moviloma ambiental. El objetivo de esta tesis fue caracterizar la estructura y prevalencia del moviloma conjugativo en el bacterioplancton de la superficie oceánica. Para ello, se ha examinado el moviloma conjugativo, primeramente, desde metagenomas marinos públicos (TARA Ocean Project) en un gradiente geográfico. Y posteriormente en una sucesión estacional (dos años) en el observatorio costero de Montemar (Viña Del Mar, Chile). Para identificar el moviloma, se utilizaron modelos ocultos de Markov para la búsqueda de marcadores moleculares como relaxasas, integrasas y el sistema de secreción del tipo 4 (T4SS). Nuestros resultados revelan que los elementos movilizables -elementos que requieren asistencia para ser conjugados- son más abundantes, y superan en número a las secuencias auto-conjugativas. Esto sugiere la cooperación entre secuencias del moviloma. Además, muestran que la adaptación moviloma-huésped favorece una prevalencia del moviloma asociado a los taxa dominantes en el sistema marino a escala temporal como geográfica.
dc.description.version2024-07-02
dc.format.extent221 páginas
dc.fuente.origenAutoarchivo
dc.identifier.doi10.7764/tesisUC/BIO/64331
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.7764/tesisUC/BIO/64331
dc.identifier.urihttps://repositorio.uc.cl/handle/11534/64331
dc.information.autorucFacultad de Ciencias Biológicas ; Diez Moreno, Beatriz ; 0000-0002-9371-8083 ; 1009001
dc.information.autorucFacultad de Ciencias Biológicas ; Tamayo Leiva, Javier ; 0000-0003-2610-6957 ; 1031203
dc.language.isoen
dc.nota.accesoContenido completo
dc.rightsacceso abierto
dc.subjectTransferencia horizontal de geneses_ES
dc.subjectMobiloma conjugativoes_ES
dc.subjectBacterioplancton marinoes_ES
dc.subjectResistomaes_ES
dc.subject.ddc500
dc.subject.deweyCienciases_ES
dc.subject.ods14 Life below water
dc.subject.odspa14 Vida submarina
dc.subject.otherPlancton Marinoes_ES
dc.subject.otherProcesos de Markoves_ES
dc.titleDecoding the mobilome of marine microbial communities and their composition in response to local environmental conditionses_ES
dc.typetesis doctoral
sipa.codpersvinculados1009001
sipa.codpersvinculados1031203
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
Thesis_PhD.pdf
Size:
12.71 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
license.txt
Size:
0 B
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:
Download
Collections
3.06 Tesis doctorado