Identificación de las proteínas hnRNP A1, hnRNP K y HUR como moduladores de la traducción cap-independiente de los mRNAS de HTLV-1 y sHBZ
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Date
2023
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Abstract
HTLV-1 es un retrovirus clasificado en el género Deltaretrovirus, perteneciente a la subfamilia Orthoretrovirinae. La traducción del mRNA genómico de HTLV-1 puede iniciar siguiendo una vía cap-dependiente o bien ser mediada por un sitio interno de entrada a ribosoma (IRES), el HTLV-1 IRES. Durante su replicación HTLV-1 expresa dos mRNAs anti-sentido que codifican para el factor de cremallera de leucina de carácter básico (HBZ), generando dos isoformas diferentes de la proteína HBZ, sHBZ y usHBZ. El inicio de la traducción de la forma usHBZ es cap-dependiente, mientras que el mRNA de sHBZ inicia de manera dependiente de un IRES, el sHBZ IRES. Basado en evidencia previa que establece que los IRESs de origen retroviral son regulados por proteínas celulares clasificadas como factores trans-activadores del IRES (ITAF), en este trabajo de tesis se evaluó el potencial rol de ITAF de las proteínas: nuclear heterogénea (hnRNP) A1, hnRNP K y el antígeno humano R (HuR). Los resultados muestran que hnRNP A1 actua como ITAF que estimula la actividad del HTLV-1 IRES y sHBZ IRES. Sin embargo, la magnitud de la estimulación ejercida por hnRNP A1 sobre el sHBZ IRES es menor que la obtenida para el HTLV-1 IRES. La sobreexpresión de hnRNP K estimula la actividad del HTLV-1 IRES sin afectar la traducción mediada por el sHBZ IRES. Indicando que hnRNP K es un ITAF para el IRES de HTLV-1 pero no para el IRES de sHBZ. Finalmente, la proteína HuR inhibe al HTLV-1 IRES y sHBZ IRES, sugiriendo que HuR es un ITAF para ambos IRES. Posteriormente, se evaluó el rol de las modificaciones post-traduccionales (PTMs), fosforilaciones y metilaciones, en la actividad de ITAF de hnRNP A1, hnRNP K y HuR para el HTLV-1 IRES y sHBZ IRES. Los resultados muestran que a excepción de la mutante hnRNP A1 R218/225K, todas las mutantes evaluadas para hnRNP A1 se comportaban como la proteína wild type (WT) estimulando a ambos IRESs. Con respecto a las mutantes evaluadas de hnRNP K se encontró que su actividad sobre los IRES de HTLV-1 y sHBZ es similar a la proteína WT. Las mutantes evaluadas para HuR, se comportaron como la proteína WT para ambos IRES. Como conclusión de este trabajo de tesis se logró identificar que las proteínas hnRNP A1, hnRNP K y HuR que impactan de manera diferencial al HTLV-1 IRES y al sHBZ IRES.
Description
Tesis (Doctor en Ciencias Biológicas con mención en Genética Molecular y Microbiología)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2023.