Effect of different strategies for excluding duplicate cultures on the correlation between hospital non susceptibility rates and antibiotic consumption

Abstract
Los estudios pueden subestimar el impacto de los antibióticos en la resistencia bacteriana cuando analizan la correlación de uso de antibióticos con las tasas de resistencia (RR) que excluyen cultivos duplicados de un mismo paciente, ya que estos cultivos contienen cepas más resistentes. Usando datos de consumo de antibióticos y de RR en Pseudomonas aeruginosa del 2017 al 2021, se compararon las correlaciones resultantes de distintas estrategias para excluir los duplicados de las RR. Los duplicados representaron el 53.45% de los cultivos. Comparamos las tasas resultantes de excluir todos los duplicados, de su exclusión mensual y de la admisión de un cultivo al día. Todos los antibióticos salvo meropenem mostraron correlación negativa o positiva con las tasas del mismo año, y positiva con las del año siguiente. Las tasas con menos duplicados (y por lo tanto menos cepas resistentes) encontraron más correlaciones. Sin embargo, la inclusión de duplicados tomados con al menos un mes de diferencia resultó en más correlaciones. En conclusión, la exclusión de duplicados de las RR afecta su correlación con el uso de antibióticos en P. aeruginosa. Incluir al menos algunos duplicados en estos análisis, como aquellos obtenidos después de un mes, debería ser considerado. Este trabajo fue realizado para postular al grado de Magíster en Investigación en Ciencias de la Salud, de la Facultad de Medicina de la Pontificia Universidad Católica de Chile
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