Browsing by Author "Tamayo Leiva, Javier"
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- ItemDecoding the mobilome of marine microbial communities and their composition in response to local environmental conditions(2022) Tamayo Leiva, Javier; Diez Moreno, Beatriz; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias BiológicasLa transferencia horizontal de genes es un proceso natural que permite que los genomas celulares evolucionen rápidamente al adquirir nuevos rasgos genéticos. Entre los cinco procesos celulares capaces de realizar la transferencia horizontal de genes, la conjugación es el más frecuente. Este mecanismo está implicado en el intercambio de vectores de ADN, llamados elementos genéticos móviles y aquí colectivamente denominados como mobiloma conjugativo. El ambiente marino muestra de forma habitual un dinamismo especialmente elevado. Por esta razón, han existido esfuerzos de investigación de la ecología y diversidad microbiana a gran escala, y por ello es un candidato ideal para el estudio del moviloma ambiental. El objetivo de esta tesis fue caracterizar la estructura y prevalencia del moviloma conjugativo en el bacterioplancton de la superficie oceánica. Para ello, se ha examinado el moviloma conjugativo, primeramente, desde metagenomas marinos públicos (TARA Ocean Project) en un gradiente geográfico. Y posteriormente en una sucesión estacional (dos años) en el observatorio costero de Montemar (Viña Del Mar, Chile). Para identificar el moviloma, se utilizaron modelos ocultos de Markov para la búsqueda de marcadores moleculares como relaxasas, integrasas y el sistema de secreción del tipo 4 (T4SS). Nuestros resultados revelan que los elementos movilizables -elementos que requieren asistencia para ser conjugados- son más abundantes, y superan en número a las secuencias auto-conjugativas. Esto sugiere la cooperación entre secuencias del moviloma. Además, muestran que la adaptación moviloma-huésped favorece una prevalencia del moviloma asociado a los taxa dominantes en el sistema marino a escala temporal como geográfica.
- ItemKanamycin treatment in the pre-symptomatic stage of a Drosophila PD model prevents the onset of non-motor alterations(2023) Molina Mateo, Daniela; Valderrama, Benjamín; Zárate, Raffaela; Hidalgo, S.; Tamayo Leiva, Javier; Soto González, Antonia; Guerra Ayala, Simón; Arriagada Vera, Vicente; Oliva, C.; Diez, B.; Campusano, Jorge M.Parkinson's disease (PD) is a neurodegenerative disorder characterized by motor alterations, which is preceded by a prodromal stage where non-motor symptoms are observed. Over recent years, it has become evident that this disorder involves other organs that communicate with the brain like the gut. Importantly, the microbial community that lives in the gut plays a key role in this communication, the so-called microbiota-gut-brain axis. Alterations in this axis have been associated to several disorders including PD. Here we proposed that the gut microbiota is different in the presymptomatic stage of a Drosophila model for PD, the Pink1B9 mutant fly, as compared to that observed in control animals. Our results show this is the case: there is basal dysbiosis in mutant animals evidenced by substantial difference in the composition of midgut microbiota in 8–9 days old Pink1B9 mutant flies as compared with control animals. Further, we fed young adult control and mutant flies kanamycin and analyzed motor and non-motor behavioral parameters in these animals. Data show that kanamycin treatment induces the recovery of some of the non-motor parameters altered in the pre-motor stage of the PD fly model, while there is no substantial change in locomotor parameters recorded at this stage. On the other hand, our results show that feeding young animals the antibiotic, results in a long-lasting improvement of locomotion in control flies. Our data support that manipulations of gut microbiota in young animals could have beneficial effects on PD progression and age-dependent motor impairments.