Browsing by Author "Rivera Álvarez, Carlos Andrés"

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    Revealing RCOR2 as a regulatory component of nuclear speckles
    (2021) Rivera Álvarez, Carlos Andrés; Verbel Vergara, Daniel Eduardo; Arancibia Radich, Duxan Andrés; Lappala, Anna; González, Marcela; Guzmán, Fabián; Merello, Gianluca; Lee, Jeannie T.; Andrés Coke, María Estela
    Background: Nuclear processes such as transcription and RNA maturation can be impacted by subnuclear compartmentalization in condensates and nuclear bodies. Here, we characterize the nature of nuclear granules formed by REST corepressor 2 (RCOR2), a nuclear protein essential for pluripotency maintenance and central nervous system development. Results: Using biochemical approaches and high-resolution microscopy, we reveal that RCOR2 is localized in nuclear speckles across multiple cell types, including neurons in the brain. RCOR2 forms complexes with nuclear speckle components such as SON, SRSF7, and SRRM2. When cells are exposed to chemical stress, RCOR2 behaves as a core component of the nuclear speckle and is stabilized by RNA. In turn, nuclear speckle morphology appears to depend on RCOR2. Specifically, RCOR2 knockdown results larger nuclear speckles, whereas overexpressing RCOR2 leads to smaller and rounder nuclear speckles. Conclusion: Our study suggests that RCOR2 is a regulatory component of the nuclear speckle bodies, setting this co-repressor protein as a factor that controls nuclear speckles behavior.
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    Unveiling non canonical roles for RCOR1 and RCOR2 transcriptional co-repressors
    (2020) Rivera Álvarez, Carlos Andrés; Andrés Coke, María Estela; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias Biológicas
    La familia de co-represores transcripcionales RCOR/CoREST comprende tres proteínas comúnmente asociadas a silenciamiento de genes neuronales en células no-neuronales y en etapas tempranas de la diferenciación neuronal. Su capacidad represora es llevada a cabo por las enzimas LSD1 y HDAC1/2, que remueven modificaciones post-traduccionales de histonas permisivas para la transcripción. Si bien las proteínas RCOR poseen alta identidad de secuencia en sus dominios funcionales, han evolucionado características bioquímicas específicas que explican por qué su capacidad represora es diferente. Paradójicamente, mientras los complejos de las proteínas RCOR han sido comúnmente asociadas a la represión de la transcripción en contextos celulares específicos, la inhibición de sus actividades enzimáticas asociadas genera un aumento en modificaciones de histonas que favorecen la transcripción, sugiriendo que el complejo actúa en dominios de eucromatina. El presente trabajo fue diseñado para caracterizar el rol de las proteínas RCOR1 y RCOR2 en dominios intranucleares asociados a expresión génica activa. En el capítulo 2, revelo a RCOR1 como un represor global de la transcripción que se recluta en dominios de eucromatina y controla la actividad de la RNA Polimerasa II. En el capítulo 3, describo a RCOR2 como un componente de speckles nucleares que estabiliza dichos organelos nomembranosos. En el capítulo 4, discuto la significancia de mis hallazgos y los relaciono con el estado del arte del campo. Finalmente, concluyo proponiendo un modelo para comprender funciones no canónicas de co-represores de la transcripción en regiones activas del genoma.