Browsing by Author "Faugeron, Sylvain Wielfrid"
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- ItemAbsence of kin structure in a population of the group-living rodent Octodon degus(2011) Quirici Valadán, Rosina Verónica.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Ebensperger Pesce, Luis Alberto
- ItemAssessment of genetic and phenotypic diversity of the giant kelp, Macrocystis pyrifera, to support breeding programs(2018) Camus, Carolina; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Buschmann, Alejandro H.
- ItemAssociation of the estrogen receptor alpha gene polymorphisms with osteoporosis in the Mexican population(2007) Gomez, Ricardo; Faugeron, Sylvain Wielfrid
- ItemBiodiversity of Rocky Intertidal Benthic Communities Associated With Copper Mine Tailing Discharges in Northern Chile(2005) Medina, M.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemDeep genetic divergence between austral populations of the red alga Gigartina skottsbergii reveals a cryptic species endemic to the Antarctic continent(2015) Billard, E.; Reyes, J.; Mansilla, A.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Guillemin, M.l.
- ItemDEFENSE EVOLUTION IN THE GRACILARIACEAE (RHODOPHYTA): SUBSTRATE-REGULATED OXIDATION OF AGAR OLIGOSACCHARIDES IS MORE ANCIENT THAN THE OLIGOAGAR-ACTIVATED OXIDATIVE BURST(2010) Weinberger, F.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemDescifrando la historia evolutiva de Gracilaria Chilensis a través del Océano Pacífico Sur(2022) Huanel Oyarzún, Oscar Roberto; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias BiológicasGracilaria chilensis es la principal alga cultivada en Chile, distribuyéndose desde Caldera (27°S) hasta Raúl Marín Balmaceda (43°S). Estudios de genética poblacional y filogeografía previos indican que las poblaciones chilenas de G. chilensis son caracterizadas por una reducida diversidad genética asociada a la sobreexplotación de las praderas naturales ocurrida hace unos 50 años y/o el efecto fundador durante la colonización de Chile a fines del Último Máximo Glacial. Gracilaria chilensis es originaria de Nueva Zelanda, donde coexiste con G. transtasmanica para la cual se ha propuesto una reciente introducción debido que es hallada principalmente cerca de puertos en la Isla Norte, sin embargo, la distribución de ambas especies a lo largo del archipiélago aún no está clara. Para entender mejor el estado actual del recurso genético de G. chilensis en Chile es necesario entender como estos dos procesos han determinado la historia evolutiva de este importante recurso algal. En la presente tesis, se evaluó la distribución e historia evolutiva de Gracilaria en Nueva Zelanda utilizando el marcador nuclear Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) (Capítulo 1), y cómo los procesos antes mencionados han influenciado la arquitectura genética de G. chilensis en Chile utilizando 2.232 SNP (Capítulo 2). Nuestros resultados confirman que G. chilensis tiene una amplia distribución a través de archipiélago de Nueva Zelanda, con una fuerte estructuración geográfica concordante con el efecto de los ciclos glaciales-interglaciares, y los principales limites biogeográficos descritos para esta región. Por otro lado, G. transtasmanica presentó una distribución parchosa, sin un patrón de estructuración de su diversidad genética, pero con señales de un crecimiento poblacional post glacial soportando una antigua presencia en Nueva Zelanda. Los análisis de ABC mostraron que la actual distribución de G. chilensis a través del océano Pacífico Sur resultó de dos eventos de colonización independientes hace unos 20,000 años atrás. Para Chile, los análisis de ABC además infirieron un cuello botella mucho más reciente asociado a la sobreexplotación de las praderas naturales G. chilensis en la década de los 70s, seguido por un rápido crecimiento poblacional posiblemente asociada a la expansión de los cultivos propagados clonalmente post sobreexplotación. Nuestro estudio reveló que la historia evolutiva de G. chilensis, ha sido marcada por recurrentes cuellos de botellas demográficos asociados a los ciclos Glaciales-Interglaciares del Pleistoceno, colonizaciones a largas distancias y perturbaciones antrópica (i.e., sobrecosecha), planteando importantes desafíos en el manejo del recurso genético erosionado de un alga intensivamente cultivada, y que se encuentra en etapas tempranas de domesticación.
- ItemDevelopment and characterization of nine polymorphic microsatellite markers in the Chilean kelp Lessonia nigrescens(2009) Faugeron, Sylvain Wielfrid; Peralta Vinagre, Gioconda Paz.; Tapia Guerrero, Javier Esteban; Tellier, Florence Marie Veronique
- ItemDevelopment of microsatellites DNA markers in the cultivated seaweed, Gracilaria chilensis (Gracilariales, Rhodophyta)(2005) Guillemin, Marie-Laure.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemDevelopment of PCR-Based Markers to Determine the Sex of Kelps(2015) Lipinska, Agnieszka P.; Ahmed, Sophia; Peters, Akira F.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Cock, J. Mark; Coelho, Susana M.
- ItemDifferential Life History Phase Expression in Two Coexisting Species of Scytosiphon (Phaeophyceae) in Northern Chile(2005) Camus, Carolina.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemDiversity, phenomenology and epidemiology of epiphytism in farmed Gracilaria chilensis (Rhodophyta) in northern Chile(2006) Leonardi, Patricia.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemEnvironmental polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) exposure and DNA damage in Mexican children(2012) Sánchez, M.; Faugeron, Sylvain Wielfrid
- ItemExperimental Transplants of the Large Kelp Lessonia Nigrescens (Phaeophyceae) in High-Energy Wave Exposed Rocky Intertidal Habitats of Northern Chile: Experimental, Restoration and Management Applications(2006) Correa M., Juan A.; Castilla, Juan Carlos; Faugeron, Sylvain Wielfrid
- ItemGenetic variation in wild and cultivated populations of the haploid diploid red alga Gracilaria chilensis: How farming practices favor asexual reproduction and heterozygosity(2008) Guillemin, Marie-Laure.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemGrado de especialización ecológica y filogeografía comparada entre el herbívoro especialista Scurria scurra y sus dos algas hospederos en la costa chilena.(2014) Meynard, Andrés; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias BiológicasEsta tesis tuvo como primer objetivo evaluar el nivel de especialización de un herbívoro marino, la patela Scurria scurra, en sus dos algas hospederos Lessonia spicata y Durvillea antartica. A partir de una revisión de conceptos y criterios, se evidenció (en el Capitulo Introductorio) que un herbívoro especialista es adecuadamente caracterizado basándose en el grado de ubicuidad y versatilidad ecológica en su uso de recursos. El termino versatilidad ecológica se refiere al rango de recursos utilizados y desempeño particular mostrado por una especie cuando explota estos recursos, en comparación a otras especies. El termino ubicuidad se refiere al rango de hábitats o de plantas utilizadas en el caso de un herbívoro especialista, y las densidades relativas del herbívoro en cada una de estas plantas o hábitats. En el segundo capítulo de esta tesis, se realizó una estimación del grado de ubicuidad y versatilidad ecológica de S. scurra respecto de sus dos algas hospederos L. spicata y D. antartica en Chile Central. Nuestra premisa inicial fue que debido a que un alga hospedero suele ser alimento y refugio para pequeños herbívoros, el mayor tamaño y complejidad estructural de L. spicata ofrecería más espacio para habitar y albergaría mayores densidades de S. scurra y de mayores tamaños que D. antartica. Se evaluó si la prevalencia de S. scurra en L. spicata y D. antartica se correlaciona con la disponibilidad relativa de estos hospederos en ocho sitios. En segundo lugar, se evaluó si la probabilidad de presencia y tamaños de S. scurra se correlacionan con el tamaño y forma de distintas estructuras (principalmente discos y estipes) de L. spicata y D. antartica. Nuestros datos sugieren que la ocurrencia de S. scurra es verdaderamente selectiva respecto de su huésped principal L. spicata, mientras que tiene un uso oportunista de D. antarctica.Concordantemente, la prevalencia de S. scurra en L. spicata osciló entre 0.7 y 1.0, mientras que en D. antartica, la prevalencia de S. scurra aumentó con el aumento de las densidades de D. antartica hacia el Sur.Regresiones logísticas sobre la presencia y el tamaño de S. scurra de acuerdo con el tamaño de diferentes estructuras de sus algas hospederos mostraron que la presencia de S. scurra está más correlacionada con el diámetro de estipes en L. spicata, y con la altura del disco en D. antartica. S. scurra alcanzó una mayor abundancia por alga y mayores tamaños en L. spicata en comparación con D. antartica. Los resultados anteriores sugieren que los rasgos morfológicos y disponibilidad de micro-hábitat en macroalgas posibilitarían alcanzar mayores abundancias en herbívoros especialistas al conferir mayor espacio para refugiarse contra enemigos o condiciones ambientales adversas. Esta tesis tuvo como segundo objetivo general evaluar el grado de concordancia de las estructuras genéticas espaciales y las señales genéticas de cambios demográficos pasados entre S. scurra y el complejo L. nigrescens (Lessonia berteroana y Lessonia spicata) en la costa Chilena (26°S to 42°S). Un primer objetivo consistió en evaluar si la diversidad genética en S. scurra muestra los mismos quiebres filogeográficos mayores verificados previamente en Lessonia para la costa de Chile: específicamente, las discontinuidades genéticas a los 30°S y a los 27°S. En segundo lugar, se investigaron los posibles cambios demográficos experimentados por ambas especies (principalmente S. scurra y L. spicata) debido a la transición Glacial-Interglacial. De hecho, un desplazamiento hacia el Norte de los Vientos de Deriva del Oeste parece haber modificado la intensidad de la surgencia al Sur de 30°S, lo que redujo la productividad primaria durante el Último Máximo Glacial (UMG).Nuestros análisis empleando marcadores AFLP confirmaron la ocurrencia de una discontinuidad genética mayor en la estructuración de las poblaciones de S. scurra consistente con la ruptura biogeografica propuesta a los 30°S.Esta ruptura también fue demostrada anteriormente en otros vertebrados e invertebrados a lo largo del intermareal de Chile y tiene probablemente un origen extrínseco o ambiental (diferentes condiciones oceanográficas a ambos lados de los 30°S). Además, la sub-estructuración de las poblaciones de S. scurraubicadas al norte de 30°S coincidió con el segundo quiebre genético observado en el complejoL. nigrescens con marcadores de ADN mitocondrial alos 27°S.Esta ruptura genética a 27°S es única deL. berteroana y S. scurra. En segundo lugar, de acuerdo a nuestros análisis con el marcador COI (reconstrucción de tamaños efectivos poblacionales en el software Beast, y simulaciones de escenarios en DYABC), el escenario demográfico más probable paraS. scurra es la extinción de sus poblaciones al Sur de los 34°S durante el UMG, seguida de una recolonización postglacial de esta zona desde refugios ubicados más al norte.Para L. spicata, el escenario más probable en virtud de simulaciones en DYABC indica que las poblaciones al Sur de los 34°S también se vieron afectados por algún cambio ambiental mayor durante el UMG y experimentaron una recuperación demográfica post-Glacial desde entonces. Este patrón, no reportado aún para especies que no fueron afectadas por la capa de hielo en América del Sur, es probablemente el resultado de un desplazamiento post-Glacial progresivo hacia el sur de los Vientos de Deriva del Oeste y el restablecimiento asociado del sistema de surgencia costera. Todo lo anterior pone de manifiesto la estrecha interacción con L. spicata y L. berteroana y la alta especialización de S. scurra, la cual no fue capaz de persistir en otros sustratos o algas durante el UMG en el sur de Chile Central. Lo anterior también es coherente con estudios recientes que apoyan la idea que la concordanciaen los patrones filogeográficos y demográficos es más probable entre organismos que mantienen interacciones ecológicas fuertes y específicas.
- ItemGroup living in the kelp Lessonia spicata(2015) Araujo Casares, Fernanda; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias BiológicasLa vida en grupo (sociabilidad) tiene consecuencias ecológicas que afectan las probabilidades de supervivencia y reproducción de los individuos. Ella crea oportunidad tanto para la cooperación cuanto para el conflicto. En última instancia, el balance entre los beneficios y costos en adecuación biológica determina el valor adaptativo de la vida en grupo en un dado ambiente. Cuando los individuos se agrupan con parientes cercanos, ellos pueden obtener beneficios indirectos a pesar de sufrir potenciales costos directos. Así, para la comprensión del valor adaptativo de la vida en grupo se requiere que se respondan cuestiones como: ¿Cuáles son los costos y beneficios relacionados a la sociabilidad? ¿Cuán frecuentemente parientes cercanos interactúan en poblaciones naturales? ¿Cuál es el grado de parentesco dentro de los grupos? En esta tesis, enfrenté el desafío de contestar estas preguntas utilizando el kelp Lessonia spicata, cuyos individuos (genotipos) se pueden fusionar originando plantas quiméricas, compuestas por dos o más líneas celulares provenientes de diferentes cigotos, como modelo de estudio para investigar las ventajas selectivas del quimerismo, un tipo peculiar pero común, de vida en grupo.En el primer capítulo de esta tesis, evalué los efectos del quimerismo sobre la reproducción (un componente de adecuación biológica normalmente no evaluado en los estudios con quimeras) en los niveles del genotipo y de la planta. Cuantifiqué la frecuencia de quimerismo en poblaciones naturales de L. spicata, comparé la inversión reproductiva genotípica promedio entre plantas quiméricas y no quiméricas y estimé el éxito reproductivo genotípico y de la planta, en plantas quiméricas y no quiméricas. En el segundo capítulo, analicé la relación entre dispersión, estructuración genética a muy pequeña escala y formación de grupos compuestos por parientes cercanos. Utilizando analices de asignación parental y de autocorrelación espacial, evalué la forma del kernel de dispersión y la presencia de estructuración genética a muy pequeña escala (40-100m) en poblaciones de L. spicata. Posteriormente, investigué la influencia de la estructuración genética en la agrupación de parientes.La frecuencia de plantas quiméricas fue alta (60-90%) en poblaciones naturales del kelp L. spicata. En general, no fueron encontrados beneficios o costos en éxito reproductivo genotípico relacionados a la vida en grupo. Sin embargo, en el nivel de la planta, el quimerismo aumentó tanto el éxito reproductivo, cuanto la probabilidad de reproducirse, principalmente debido al aumento del número de genotipos que se reproducen en plantas quiméricas. Este estudio sugiere que la vida en grupo resulta en beneficios en reproducción para L. spicata. Los kernels de dispersión mostraron que la mayoría de los eventos de reclutamiento ocurrió a cortas distancias de la fuente parental (14-40m), a pesar de la heterogeneidad observada entre los sitios de estudio. De la misma manera, uno de los sitios presentó estructuración genética significativa en la coorte de reclutas. Además, encontré concordancia entre la presencia de estructuración genética en reclutas y parentesco significativo dentro de grupos en plantas adultas, lo que sugiere que la estructuración genética a pequeña escala puede llevar a la agrupación de parientes cercanos en poblaciones de L. spicata. De esta forma, este estudio ha demostrado que la dispersión limitada puede causar estructuración genética a pequeña escala en L. spicata.Entonces, la alta ocurrencia de quimeras en poblaciones naturales parece resultar de la fusión de genotipos altamente endogámicos, potencialmente involucrando también beneficios en adecuación biológica inclusiva. Esta tesis ha generado conocimiento importante sobre la vida en grupo en L. spicata que complementa estudios previos sobre quimerismo en algas marinas. Diversas evidencias parecen indicar que el quimerismo es una estrategia adaptativa en algas marinas: i) este es común en varias especies de algas verdes, rojas y cafés; ii) confiere ventajas selectivas en estadios tempranos del ciclo de vida; iii) su frecuencia parece estar relacionada a condiciones ambientales estresantes; iv) aumenta la densidad the reproductores; v) probablemente ocurre mayormente entre parientes cercanos, sugiriendo la posibilidad de beneficios indirectos dentro de grupos. Estudios futuros que investiguen los efectos del parentesco sobre diferentes componentes de adecuación biológica son necesarios para un completo entendimiento de los mecanismos responsables por la evolución y la mantención del quimerismo en L. spicata y en otras algas marinas.
- ItemHierarchical Spatial Structure and Discriminant Analysis of Genetic Diversity in the Red Alga Mazzaella Laminarioides (Gigartinales, Rhodophyta)(2001) Faugeron, Sylvain Wielfrid; Correa M., Juan A.
- ItemHigh-density genetic map and identification of QTLs for responses to temperature and salinity stresses in the model brown alga Ectocarpus(2017) Avia, K.; Coelho, S.; Montecinos Arismendi, Gabriel José; Cormier, A.; Lerck, F.; Mauger, S.; Faugeron, Sylvain Wielfrid; Valero, Myriam; Cock, J.; Boudry, P.
- ItemHigher reproductive success for chimeras than solitary individuals in the kelp Lessonia spicata but no benefit for individual genotypes(2016) Araujo, F.; Faugeron, Sylvain Wielfrid
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