Design of a preprocessing system for sounds obtained from chest auscultation

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2021
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Abstract
La auscultación es un proceso simple, de bajo costo y no invasivo para realizar diagnósticos de enfermedades respiratorias. Sin embargo, sus principales dificultades es que estos sonidos se concentran en una banda de frecuencia muy baja, se traslapan con los sonidos cardiacos y su interpretación está sujeta a la experiencia del médico. Con el avance de la tecnología se han creado estetoscopios digitales que permiten registrar estos sonidos para analizarlos. En este trabajo se propone el diseño de un sistema de dos etapas. En la primera etapa se realiza la detección de los sonidos cardiacos fundamentales usando una CNN con arquitectura encoder-decoder sobre una base de datos de 792 fonocardiogramas de 135 pacientes distintos (54 de estos pacientes presenta alguna patología cardiaca). En esta etapa se reporta un alto desempeño (cercano a 93±1.1% para distintas métricas como exactitud, sensibilidad, precisión y valor F1) a partir de una validación cruzada de k = 10 iteraciones. Además, se muestra que es un sistema robusto que presenta un alto desempeño independiente de las características de entrada de la red. En la segunda etapa se proponen distintos métodos de separación de fuentes mediante un proceso de descomposición con Factorización No Negativa de Matrices (NMF). Entre los métodos propuestos, los que aplican NMF sobre la señal completa y reemplazan los segmentos en la posición del sonido cardiaco con el sonido respiratorio estimado, en conjunto con el criterio de asignación de componentes basado en la correlación temporal con las posiciones del sonido cardiaco obtienen mejores resultados en cuanto a la reconstrucción del sonido respiratorio (! 0.96±0.01 en correlación temporal y espectral, 0.001±0.0006 en error cuadrático medio y 11.86±1.59 dB en razón señal a distorsión). A partir de este proceso, se tendrá un sonido respiratorio limpio que podría ser utilizado en un sistema de clasificación de enfermedades respiratorias.
Description
Tesis (Master of Science in Engineering)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2021
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