Open platform for the implementation of RNA sensing reactions in cell-free systems
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Date
2021
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Abstract
La biología sintética busca el desarrollo de funciones programables y
predecibles en sistemas biológicos. Uno de los recientes avances en esta área
son los toehold swtiches: reguladores de la expresión genética diseñados denovo y que permiten la traducción de un gen de forma gatillada por la
interacción con un RNA trigger" de secuencia especifica.
Por otro lado, los sistemas de expresión genética libre de células (cell-free)
han sido utilizados durante décadas en el campo de la biología molecular y
fueron claves en el descubrimiento del código genético. Sin embargo, solo
muy recientemente han empezado a utilizarse como una herramienta para
la bioingeniería. La expresión de toehold swtiches en sistemas de libre de
células generó una plataforma de diagnóstico muy promisoria ya que los
sensores de RNA tipo toehold pueden ser liofilizados para su transporte
a temperatura ambiente con el objetivo de ser utilizadas en terreno y en
zonas remotas. No obstante, a la fecha, estos sensores solamente han sido
implementados en sistemas de expresión genética reconstituidos, del tipo
PURE (por sus siglas en inglés: Protein expression Using Reconstituted
Elements). Los sistemas PURE requieren transporte en fr´ıo (-80 C) desde
los proveedores en el hemisferio norte, y son prohibitivamente caros para
los usuarios en América Latina.
Description
Tesis (Doctor in Biological Sciences with mention in Molecular Genetics and Microbiology)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2021